Perustettiin Isonkyrön emäseurakunnan kappeliksi saatuaan kappalaisen 1658. Kirjallisuudessa on esitetty, että seurakunnan ensimmäinen kirkko olisi rakennettu jo 1568 ja pyhitetty Pyhälle Mikaelille, mutta toisen tiedon mukaan kirkko olisi rakennettu vasta 1658. Kirkko kärsi paljon vaurioita isonvihan aikana. Erotettiin Isostakyröstä itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi keisarin käskykirjeellä 7.2.1859. Ylistaron kunta perustettiin 1867 ja liitettiin Seinäjoen kaupunkiin 2009.
Kylät
Heikkola, Isokylä, Kainasto, Kaukola, Kuivila, Lahti, Mettälä, Pelma, Topparla, Torkkola, Ulvila, Untamala
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kirkkoherran virkatalosta keisarin käskykirje 29.11.1881.
Kirkkoherrat
1881–1893 Salomon Hirvinen
1894–1909 Johan Heininen
1911–1912 Otto Alfred Airio
1914 Frans Vihtori Leino, kuoli ennen virkaan astumista
1916–1926 Pekka Rudolf Heikinheimo
1927– Arvi Malmivaara
Kappalaiset
1658–1677 Laurentius Petri Wasensis
1679–1695 Gustavus Isaaci Brennerus
1697–1705 Claurius Holstius
1706–1717 Andreas Affrén
1722–1732 Israel Alftan
1733–1738 Johan Ulsing
1738–1741 Matthias Choraeus
1741–1752 Barthold Kennelius
1753–1765 Matthias Leschelius
1766–1794 Jonas Spoof
1796–1806 Nils Aejmelæus
1811–1827 Johan Stenbäck
1827–1846 Karl Fredrik Lilius
1848–1854 Josef Vilhelm Durchman
1854–1862 Bror Henrik Reinhold Aspelin
1863–1866 Gustaf Erik Forsman
1868–1884 Viktor Fredrik Lilius
1887–1896 Erik Snellman
1897–1934 Johan Fredrik Viluksela (Olin)
Ylimääräiset papit
1764–1766 Birger Widlund, kappalaisen viran armovuodensaarnaaja
1775–1783 Anders Törnudd, kappalaisen apulainen
1783– Nils Aejmelaeus, kappalaisen apulainen
1805–1806 Herman Malmberg, kappalaisen apulainen
1807–1811 Johan Simelius, armovuoden- ja välisaarnaaja
1827 Johan Reinhold Aejmelæus, välisaarnaaja
1832–1833 Gustaf Löwenmark, kappalaisen apulainen
1833–1834 Johan Grönström, kappalaisen apulainen
1834–1841 Karl Adolf Lilius, kappalaisen apulainen
1841–1845 Viktor Fredrik Lilius, kappalaisen apulainen
1845–1846 Anders Johan Lilius, kappalaisen apulainen
1862–1863 Anders Oskar Törnudd, välisaarnaaja
1866–1868 Gustaf Gideon Forsman, kappalaisen apulainen, armovuodensaarnaaja
1884–1887 Karl Julius Jonatan Helander, armovuodensaarnaaja
1893–1894 Evertti Kustaa Forsman, välisaarnaaja
1896–1897 Konstantin Leander Ahlman, välisaarnaaja
1905–1910 Kalle Fredrik Kuusisto, kirkkoherran apulainen, vt. kirkkoherra
1921 Kaarlo Aaron Aukee, kirkkoherran apulainen
Arkisto
Ylistaron seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1727, tilikirjat vuodesta 1724 ja historiakirjat vuodesta 1714. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Vaasassa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1718–1927.
Kansallisarkisto on digitoinut Ylistaron seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1850-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.