Perustettiin, kun Ilomantsin emäseurakunta määrättiin keisarillisen senaatin kirjeessä 26.2.1896 jaettavaksi siten, että muodostettavaan Koveron kirkkoherrakuntaan tuli kuulumaan Ilomantsin lounainen puoli eli Konnunniemen, Kortevaaran, Koveron, Sonkajarannan, Öllölän, Luutalahden, Eimisjärven, Pirttijärven ja Kinnasniemen kyläkunnat. Koveron kylän mainitaan kuuluneen Ilomantsin pogostan Sonkajan perevaaraan 1500 ja kylä mainitaan autiona 1589. Perustettaessa seurakunta määrättiin kirkkoherran yksin hoidettavaksi ja sen kirkko rakennettavaksi Tuupovaaran Konnunniemen kylään. Kirkon piirustukset vahvistettiin 4.4.1898. Koveron kunta perustettiin 1910. Seurakunnan ja kunnan nimi muutettiin Tuupovaaraksi 1913. Tuupovaaran kuntaan liitettiin osa lakkautetusta Korpiselän kunnasta 1946. Tuupovaara liitettiin Joensuun kaupunkiin 2005.
Muut nimet
Kovero
Maakirjakylät
Eimisjärvi, Kinnasniemi, Konnunniemi, Kortevaara, Kovero, Luutalahti, Pirttijärvi, Sonkajanranta, Öllölä
Naapuriseurakunnat
Papisto
Seurakuntalaiset vapautettiin Ilomantsin kirkon rakentamisvelvollisuudesta. Perustamisen yhteydessä seurakunta määrättiin hankkimaan virkataloksi vähintään 1/8 manttaalia maata. Virkatalon ja kirkon tuli olla kunnossa ennen kuin kirkkoherran viran sai julistaa haettavaksi.
Ylimääräiset papit
1902–1903 Johan Hotinen, vt. kirkkoherra
1904–1909 Akseli Kytö, vt. kirkkoherra
1909– Antero Juhana Räty, vt. kirkkoherra
Arkisto
Tuupovaaran seurakunnan rippi- ja historiakirjat alkavat vuodesta 1902.
Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut Tuupovaaran seurakunnan kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.