Alkuaan Euran emäseurakunnan kappeli, jollaisen mainitaan 1481. Säkylä mainitaan paikkakuntana ainakin jo 1392. Erotettiin itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi ja pitäjäksi 1639. Seurakunnalla oli aikanaan yhteinen kappalainen Köyliön kanssa. Säkylän kunta perustettiin 1869. Vuoden 2016 alueliitoksen myötä seurakuntaan kuuluu nykyään myös Köyliön Kappeliseurakunta. Seurakunta on nykyään nimeltään Säkylän-Köyliön seurakunta.
Kylät
Iso-Säkylä, Korpi, Löytäne, Pyhäjoki, Vähä-Säkylä
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kappalaisen virkatalo annettiin kuninkaan käskykirjeellä 15.11.1699. Säkylän pappilaa varten Suomen kenraalikuvernööri, kreivi Per Brahen 30.6.1659 antama Jaakkolan prebendatila tuotti noin 500 markkaa vuodessa vielä 1890-luvulla.
Kirkkoherrat
1722–1729 Johan Bergbom
1730–1753 Henrik Laihiander
1755–1784 Anders Elgforth
1785–1798 Henrik Johan Bergroth
1800–1809 Anders Eldén
1810–1825 Fredrik Johan Colérus
1826–1832 Johan Arell
1836–1846 Karl Gustaf Mellberg
1846–1855 Otto Johan Brander, ensin vt. kirkkoherra
1856–1866 Gustaf Molin
1867–1872 Emil Ferdinand Bergroth
1872–1881 Axel Richard Mauritz Creutlein, ensin vt. kirkkoherra
1882–1899 Vilhelm Adrian Mandellöf
1900–1928 Pekka (Pietari) Korhonen
1929–1951 Kaarlo Kustaa Käes (Klockarla)
Kappalaiset
? Laurentius
1633 Martinus
Kappalaiset Köyliön kanssa yhteiset
1730–1745 Simon Fonselius
1746–1790 Thomas Lindqvist
1792–1815 Mikael Ingelius
1817–1826 Nils Mikael Ingelius
1828–1857 Gustaf Pælander
1859–1864 Henrik Vilhelm Nordlund
1866–1902 Konrad Helenius
1904–1908 Matti Tienari
1908–1912 Kaarlo Nestori Parikka
1913–1929 Kaarlo Kustaa Käes (Klockarla)
Ylimääräiset papit
1747– Anders Elgfoth, kirkkoherran apulainen
1758– Gregorius Sommarfelt, kappalaisen apulainen
1770– Georg Montén, kirkkoherran apulainen
1783– Jakob Herman Packalén, kirkkoherran apulainen
1784–1785 Adolf Ström, kappalaisen apulainen
1808–1810 Isak Nordlund, kirkkoherran apulainen, välisaarnaaja
1810–1812 Matias Grönberg, kappalaisen apulainen
1812–1814 Mikael Kellman, kappalaisen apulainen
1814–1817 Nils Mikael Ingelius, kappalaisen apulainen, vt. kappalainen
1823–1824 Karl Fredrik Gråå, kirkkoherran apulainen, armovuodensaarnaaja
1825–1826 Anders Helenius, välisaarnaaja
1827–1828 Klas Johan Kemell, armovuodensaarnaaja
1830–1834 Erik Vallenborg, kirkkoherran apulainen, armovuodensaarnaaja
1834–1836 Erik Eldén, armovuodensaarnaaja
1855–1856 Karl Johan August Gotthard Leidenius, välisaarnaaja
1856–1859 Nils Johan Jungberg, virka- ja armovuodensaarnaaja
1864–1866 Oskar Grönholm, välisaarnaaja
1900 Vihtori Malakias Kaipio, vt. kirkkoherra
Arkisto
Säkylän seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1730, tilikirjat vuodesta 1723 ja historiakirjat vuodesta 1680. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Turussa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1680–1887.
Kansallisarkisto on digitoinut Säkylän seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1860-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.