Perustettiin Euran emäseurakunnan rukoushuonekunnaksi, kun Honkilahden kylän asukkaat rakensivat itselleen kirkkorakennuksen tuomiokapitulin päätöksellä 13.5.1657. Muodostettiin kappeliseurakunnaksi 1693 ja seurakunta sai oman kappalaisen, kun kappalaisen palkasta tehtiin suostumus 20.8.1738. Määrättiin liitettäväksi Hinnerjoen emäseurakuntaan keisarillisen senaatin päätöksellä 16.3.1897 silloisen Euran kirkkoherran poistuessa virasta. Liitosta ei kuitenkaan ehditty toteuttaa ennen päätöstä erottaa Honkilahti Eurasta itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi 1904. Honkilahden kunta perustettiin 1904 ja liitettiin Euran kuntaan 1970.
Muut nimet
Hongilaks, Honkilaks
Maakirjakylät
Auvainen, Haveri, Honkilahti (Kirkonkylä), Komoinen, Lellainen, Löyttylä, Mannila
Naapuriseurakunnat
Eura, Hinnerjoki, Karjala, Säkylä, Yläne
Papisto
Kappalaisen palkasta tehtiin suostumus 20.8.1738. Seurakuntalaisten rakentamisvelvollisuudesta tuomiokapitulin vahvistuksessa 11.9.1754. Kappalaisen palkasta keisarin käskykirjeissä 30.11.1871 ja 4.12.1873. Keisarillisen senaatin päätöksellä 16.3.1897 talollisten tuli maksaa manttaaliensa mukaan 500 kiloa heiniä ja kuusi kuutiota halkoja kutakin manttaalia kohti kappalaisen virkatalon ylläpitämiseksi, kunnes uusi parempi virkatalo hankittaisiin.
Kappalaiset
1738–1752 Martin Ståhlberg
1753–1769 Anders Wagnbäck
1769–1779 Isak Rothovius
1780–1798 Anders Nummelin
1799–1809 Erik Johan von Pfaler
1810–1840 Johan Ekbom
1844–1871 August Fredrik Mittler
1873–1880 Karl Viktor Berghäll
1895–1906 Gabriel Erik Stenfors
Apupapit ja armovuodensaarnaajat
1749–1751 Karl Wallgrund
1752– Markus Lagerlund
1841–1842 Gustaf Adrian Jordan
1842–1844 Klas Adolf Karsten
Ylimääräiset papit
1817–1819 Anders Helenius, kappalaisen apulainen
1820–1828 Mikael Vilhelm Vahlberg, kappalaisen apulainen
1828–1838 Johan Gustaf Gottleben, sijainen
1838–1839 Gustaf Polviander, sijainen
1839–1841 Per Aulin, vt. kappalainen
1881 Johan Adolf Kerppola, vt. kappalainen
1881–1888 Berndt Vilhelm Sandell, vt. kappalainen
1888–1893 Yrjö Julius August Ask, vt. kappalainen
1893–1895 Johan Yrjö Akilles Vuorinen, vt. kappalainen
1906 Herman Miettinen, vt. kappalainen
1906–08 Wilhelm Adrian Mandellöf, vt. kappalainen
1908– Väinö Alban Suojamaa, vt. kappalainen
Arkisto
Honkilahden seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1731 ja historiakirjat vuodesta 1754. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Turussa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1731–1937.
Kansallisarkisto on digitoinut Honkilahden seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1890-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.