Perustettiin Ulvilan emäseurakunnan rukoushuonekunnaksi 1763, kun seurakunnan ensimmäinen kirkkorakennus valmistui. Muodostettiin kappeliseurakunnaksi 1764 ja ensimmäinen kappalainen astui virkaansa 1765. Kirkkoa laajennettiin 1835. Erotettiin Ulvilasta itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi keisarin käskykirjeellä 18.11.1861. Seurakunnassa sijainneen rukoushuoneyhdistyksen säännöt vahvistettiin 10.11.1896. Nakkilan kunta perustettiin 1861.
Maakirjakylät
Anola, Arantila, Korpi, Kukonharja, Kourila, Kyrkholm, Lammainen, Lautila, Leistilä, Masia, Myllärinkylä, Nakkila, Pakkala, Panelia, Ruhade, Ruskela, Soinila, Tattara, Viikala, Villilä
Naapuriseurakunnat
Papisto
Papiston palkasta maaherran päätöksessä 28.2.1805. Keisarin päätöksen 7.1.1856 mukaan seurakunta ei olllut velvollinen ottamaan osaa emäseurakunnan kappalaisen palkkaamiseen. Kirkkoherran pienemmistä saatavista Keisarillisen senaatin päätöksessä 17.1.1863.
Kirkkoherrat
1874–1885 Johan Eggert Åberg
1888–1912 Karl Oskar Kraft
1914–1923 Ernst Vilhelm Sandell
1925–1932 Matti Hiltula
1932–1951 Antti Perheentupa
Kappalaiset
1765–1769 Henrik Riman
1770–1784 Samuel Granlund
1784–1789 Johan Becker
1790–1797 Johan Avolin
1798–1801 Isak Vellenius
1802–1822 Daniel Bergroth
1823–1852 Gustaf Grönholm
1854–1867 Frans Josef Vadén
Viralliset apulaiset
1885–1886 Karl Gustaf Elomaa, vt. kirkkoherra
1886–1888 Vilhelm Kaitila, vt. kirkkoherra
1895 Akseli Topias Toikka, vt. kirkkoherra
1896 Frans Oskar Lampola, kirkkoherran apulainen
1896 Johan Alfred Lilius, kirkkoherran apulainen
1897 Edvard Kajander, kirkkoherran apulainen, vt. kirkkoherra
1897–1898 Abel Kivioja, kirkkoherran apulainen
1900–1905 Edvard Kajander, kirkkoherran apulainen, vt. kirkkoherra
1908 Isak Teodor Tarmo, virallinen apulainen
1944–1954 Toivo Tunturi
Ylimääräiset papit
1806–1807 Adam Pihlman, kappalaisen apulainen
1812–1823 Gustaf Grönholm, kappalaisen apulainen, vt. kappalainen
1841 Henrik Vilhelm Nordlund, vt. kappalainen
1841–1843 Otto Reinhold Halleen, kappalaisen apulainen
1851–1854 Gustaf Grönholm nuorempi, vt. kappalainen
1867–1874 Eliel Tiodolf Lagus, vt. kappalainen
Arkisto
Nakkilan seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1765, tilikirjat vuodesta 1765 ja historiakirjat vuodesta 1765. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Turussa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1764–1970.
Kansallisarkisto on digitoinut Nakkilan seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1870-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.