Alkuaan Tammelan emäseurakunnan kappeli. Tammelan pitäjän Humppilan neljänneksessä mainitaan emäseurakunnan papiston saarnanneen joka kuudes pyhä jumalanpalveluksia 1688. Emäseurakunnan pitäjänapulainen siirrettiin Humppilaan 1771. Kappeliseurakunnalla oli yhteinen kappalainen Jokioisten ja Perttulan eli Ypäjän kappelien kanssa, kunnes seurakuntaan määrättiin oma kappalainen Keisarillisen senaatin päätöksellä 18.10.1871. Erotettiin Tammelasta itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi Keisarillisen senaatin päätöksellä 3.11.1893. Kirkko paloi perustuksiaan myöden 1.1.1917. Humppilan kunta perustettiin 1873.
Maakirjakylät
Huhti, Humppila, Koivisto, Murto, Taipale, Venäjä (Ryssböle)
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kirkkoherrat
1902–1908 Kaarlo Viktor Hurmerinta
1909– Kustaa Iivari Savander
Kappalaiset
1659–1674 Gregorius Martini
1675–1683 Matthias Langius
1678–1709 Gabriel Lagus
1710 Laurentius Sariin
1711–1716 Thomas Amnelius
1717–1722 Johan Barck
1722–1746 Michael Sadenius
1746–1799 Gabriel Sandstén
1799– Anders Planman
1873–1875 Arvid Lundén
1888–1896 Johan Kristian Mäkinen, virka lakkautettiin
Pitäjänapulaiset
1772–1798 Johan Rangelius
1798–1799 Johan Järnström, armovuodensaarnaaja
1799–1814 Mikael Åkerblom
1815–1829 Elias Montén
1831–1838 Berndt Fredrik Gedda
1838–1842 Bernhard Taxell
1846–1855 Emil Ferdinand Bergroth
1856–1866 Konrad Helenius
Ylimääräiset papit
1823–1825 Johan Canstrén, pitäjänapulaisen apulainen
1827–1831 Anders Gustaf Gonnander, pitäjänapulaisen sijainen
1833–1838 Erik Vilhelm Rangelius, vt. apulainen
1842–1846 Emil Ferdinand Bergroth, vt.
1855–1856 Anders Abraham Favorin, vt.
1866–1870 Edvard Vilhelm Lybeck, vt.
1870–1873 Johan Holmberg, vt.
1873–1878 Berndt Gustaf Lindell, vt. kappalainen
1878–1880 Karl Oskar Mannström, vt. kappalainen
1880–1882 Lauri Vihtori Pajula, vt. kappalainen
1882–1885 Anton Malakias Havonen, vt. kappalainen
1885–1888 Axel Rudolf Leván, vt. kappalainen
1896 Frans Oskar Lampola, vt. kappalainen
1896–1898 Simo Oskari Korpela, vt. kappalainen
1898–1902 Kaarlo Viktor Hurmerinta, vt. kappalainen, vt. kirkkoherra
1904–1905 Kalle Heribert Kahiluoto, kirkkoherran apulainen
1908–1909 Leonard Mikael Wallén, vt. kirkkoherra, välisaarnaaja
Arkisto
Humppilan seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1825, tilikirjat vuodesta 1842 ja historiakirjat vuodesta 1824. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Hämeenlinnassa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1771–1942.
Seurakunnan pappila paloi 7.11.1824, jolloin tuhoutui koko kirkonarkisto.
Kansallisarkisto on digitoinut Humppilan seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1860-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.