Perustettiin Isonkyrön rukoushuonekunnaksi 1561 ja muodostettiin kappeliksi nimellä Alastaro 1593. Erotettiin Isostakyröstä itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi 1607, jolloin sai nimen Vähäkyrö. Kirkon rakentamista varten myönnettiin kruununviljaa 1614. Useita seurakuntaan kuuluneita tiloja yhdistettiin Vaasan eli Mustasaaren kaupunkiseurakuntaan 1651. Kirkko kärsi vaurioita isonvihan aikana. Vähänkyrön kunta perustettiin 1868 ja liitettiin Vaasan kaupunkiin 2013.
Muut nimet
Alastaro, Lillkyro
Kylät
Haarajoki, Hiiripelto, Hyyriä, Järvenkylä, Kalsila, Krekilä, Kuuttila, Merikaarto, Mullonkylä, Ojaniemi, Perkiö, Saarenpää, Saarensivu, Savilahti, Selkämäki, Tapoila, Tervajoki, Torkkola
Naapuriseurakunnat
Isokyrö, Koivulahti, Laihia, Mustasaaren ruotsalainen seurakunta, Mustasaaren suomalainen seurakunta, Mustasaari, Vöyri
Papisto
Kappelille annettiin Herälän tila kappalaisen virkataloksi 1588. Kirkkoherralle suoritetuista halkomaksuista kihlakunnanoikeuden pöyäkirjassa 11.1.1731 ja maanjako-oikeuden pöytäkirjassa vuonn 1768. Suostumus kirkkoherran palkasta tehtiin 27.2.1735. Kruunun suorittamat korvausjyvät lakkautettiin uudella palkkausjärjestyksellä 1898.
Kirkkoherrat
1608–1609 Casparus Martini Ahlstadius
1609–1644 Jacobus Henrici Tavastius
1645–1667 Martinus Caspari Ahlstadius
1669–1691 Andreas Michaelis Fant
1693–1704 Johannes Johannis Sarman
1705–1714 Laurentius Nicolai Qvist
1721–1742 Johannes Jacobi Gumse
1742–1763 Henrik Wallenborg
1765–1791 Henrik Henriksson Wegelius
1793–1804 Jacob Henriksson Wegelius
1806–1809 Gabriel Rein
1810–1818 Johan Forsman
1819–1839 Sakarias Forsman
1841–1850 Elias Lagus
1853–1875 Jonas Anton Erlin
1877–1883 Johan Wilhelm Nybergh
1885–1900 Henrik Nybergh
1902–1915 Oskar Forsman
1917–1921 Juho Oskari Waismaa
1923–1926 Oskar Gustaf Johannes Alander
1927–1932 Johan Viktor Edvard Varpio
Kappalaiset
1593 Sigfrid
–1608 Casparus Martini Ahlstadius
Jacobus Henrici Tavastius
1626–1645 Martinus Caspari Ahlstadius
1646–1649 Henricius Jacobi Tavastius
1651–1654 Henric Thomae Muollovius (Mullo)
1654–1683 Mathias Johannis Mullander
1685–1692 Casparus Martini Ahlstadius
1694–1717 Jacobus Henrici Mullovius
1721–1748 Johannes Johannis Moliis
1749–1750 Thomas Caroli Hammar
1751–1753 Johan Jacobi Elenius
1755–1781 Carl Johannis Rein
1782–1806 Gabriel Rein
1807–1819 Sakarias Forsman
1820–1837 Johan Daniel Alcenius
1838–1860 Nils Henrik Chydenius
1863–1880 Karl Josef Häggström
1882–1892 Johan Jakob Westerlund
1893–1898 Matti Tarkkanen
1899–1909 Aleksanteri Saarinen
1909–1917 Juho Oskari Waismaa
1917–1921 Juho Kustaa Saarento
1921–1923 Oskar Gustaf Johannes Alander
1923–1924 Akseli Aapeli Saarisalo
1925–1927 Johan Viktor Edvard Varpio
Ylimääräiset papit
1731–1732 Petter Cajanus, kirkkoherran apulainen
1737– Mikael Gumse, kirkkoherran apulainen
1737– Thomas Hammar, kappalaisen apulainen
1753– Kristian Fellman, vt. kappalainen, kappalaisen viran armovuodensaarnaaja
1769– Gabriel Rein, kappalaisen apulainen
1790– Nils Lagus, kirkkoherran apulainen
1792– Henrik Wegelius, vt. kirkkoherra
1794–1795 Matthias Enegren, kappalaisen apulainen
1802–1812 Fredrik Rein, kirkkoherran apulainen, vt. kappalainen, armovuodensaarnaaja
1804–1807 Karl Fredrik Alcenius, vt. kappalainen, kappalaisen viran armovuodensaarnaaja
Arkisto
Vähänkyrön seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1728, tilikirjat vuodesta 1756 ja historiakirjat vuodesta 1708. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Vaasassa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1607–1956.
Kansallisarkisto on digitoinut Vähänkyrön seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1860-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.