Muodostettiin Porvoon emäseurakunnan rukoushuonekunnaksi ensimmäisen oman kirkkorakennuksen valmistuttua 1606. Muodostettiin Askolan emäseurakunnan kappeliksi 15.5.1639. Askolan kirkkoherrakunnan perustaminen kuitenkin peruttiin seuraavana vuonna ja Askolasta sekä Pukkilasta muodostettiin Porvoon kappeliseurakunta, jolla oli yhteinen Askolassa asunut kappalainen.
Seurakunnan kirkko ryöstettiin 1742. Seurakunnan pappila, talli ja muut rakennukset paloivat 23.6.1841. Erotettiin Porvoosta itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi Keisarillisen senaatin päätöksellä 20.10.1896 ja ensimmäinen kirkkoherra astui virkaansa 1900. Pukkilan kunta perustettiin 1898.
Muut nimet
Savijoki
Maakirjakylät
Kantele (Kandila), Pukkila (kirkonkylä), Naarkoski, Savijoki, Syvänoja, Torppi
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kappalaisen palkasta Keisarillisen senaatin päätökset 4.4.1832, 18.4.1861 ja 21.10.1864.
Kirkkoherrat
1900–1909 Johan Ivar Wallenius
1910–1923 Adolf Werner Kyrö
1923–1932 Toivo Emil Aaltio
1932–1962 Verner Anselm Urhonen
Kappalaiset
1687–1702 Samuel Frostman
1703–1710 Samuel Tönnerus
1717–1723 Anders Orræus
1726–1731 Jonas Frostman
1734–1769 Sigfrid Jerpenius
1772–1774 Erik Candelin
1784–1798 Lars Cairenius
1800–1806 Johan Bonberg
1807–1837 Henrik Ingell
1841–1843 Karl Fredrik Barck
1843–1848 Karl Alfred Nysten
1849–1862 Henrik Renqvist
1862–1880 Karl Ekman
1885–1899 Johan Ivar Wallenius, virka lakkautettiin
Ylimääräiset papit
1803–1804 Peter Johan Sundström, kappalaisen apulainen
1804–1807 Henrik Ingell, kappalaisen apulainen, armovuodensaarnaaja
1831–1832 Lars Romell, kappalaisen apulainen
1833–1834 Jonas Justén, kappalaisen apulainen
1837 Lars Peter Reinhold Hoffrén, kappalaisen apulainen
1837–1839 Gustaf Mauritz Lundeqvist, kappalaisen apulainen, armovuodensaarnaaja
1839–1841 Henrik Konstantin Corander, armovuodensaarnaaja
1842 Henrik Renqvist, kappalaisen apulainen
1842–1843 August Tolpo, kappalaisen apulainen
1848–1849 Gustaf Reinhold Blomqvist, välisaarnaaja
1878 Karl Julius Karsten, kappalaisen apulainen
1878–1879 Paavo Poutiainen, vt. kappalainen
1879 Adolf Tiainen, vt. kappalainen
1879–1880 Emil Ferdinand Murén, vt. kappalainen
1880–1881 Isak Artur Blom, vt. kappalainen, samalla Askolassa
1881–1885 Peter Alfred Eriksson, vt. kappalainen
1899–1900 Johan Ivar Wallenius, vt. kirkkoherra
1908 Juho Arvi Metsovaara, vt. kirkkoherra
1909 Akseli Alfons Kajanti, vt. kirkkoherra, virka- ja armovuodensaarnaaja
1909–1910 Adolf Werner Kyrö, virka- ja armovuodensaarnaaja, vt. kirkkoherra
1910 Toivo Kukkonen, vt. kirkkoherra
1911–1912 Oskar Vilhelm Lindberg, kirkkoherran apulainen
1915 Vilho Anselm Vuorela, vt. kirkkoherra
Arkisto
Pukkilan seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1702, tilikirjat vuodesta 1677 ja historiakirjat vuodesta 1699. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Hämeenlinnassa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1699–1924.
Kansallisarkisto on digitoinut Pukkilan seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1880-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.