Alkuaan Uskelan emäseurakunnan kappeli, jolla mainitaan olleen oma kappalainen ainakin jo 1625. Salo mainitaan paikkana jo 1325. Seurakunta yhdistettiin Uskelaan 1833, jolloin kappalaisen virka muutettiin emäseurakunnan kappalaisen viraksi. Erotettiin itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi 1906. Ero toteutui 1914, jolloin ensimmäinen kirkkoherra astui virkaansa. Salon kauppala perustettiin keisarin käskykirjeellä 20.6.1887, jolloin siihen kuului kokonaisuudessaan 129 tynnyrinalaa maata. Salon kauppala perustettiin itsenäiseksi kunnaksi 1891 ja muodostettiin kaupungiksi 1960.
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kirkkoherrat
1914–1946 Heikki Vilhelm Linkonen (Lindgren)
Kappalaiset
1728–1740 Erik Salovius
1741–1768 Gabriel Cretalenius
1769–1782 Jeremias Kruuse
1783–1809 Abraham Paulin
1809–1833 Henrik Leidenius, virka siirrettiin Uskelaan
Ylimääräiset papit
1776–1783 Abraham Paulin, kappalaisen apulainen
Arkisto
Salon seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1696, tilikirjat vuodesta 1742 ja historiakirjat vuodesta 1629. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Turussa ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1329–1945.
Kansallisarkisto on digitoinut Salon seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1860-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Suomen Sukuhistoriallinen yhdistys (SSHY) on digitoinut seurakunnan nuorempia kirkonkirjoja. Alle 125 vuotta vanhojen aineistojen tutkiminen vaatii kirjautumisen yhdistyksen jäsensivuille.