Perustettiin kirkkoherrakunnaksi ilmeisesti jo katolisella ajalla. Föglö mainitaan paikkana jo noin 1270. Seurakunnan kirkko rakennettiin ilmeisesti 1400-luvulla. Kirkko laajennettiin ristikirkoksi 1860–1861, josta keisarillinen senaatti antoin päätöksen 5.6.1847.
Seurakuntaan kuuluneet Kökar ja Sottunga mainitaan kappeleina 1544, ja näistä ensiksi mainittu erotettiin itsenäiseksi kirkkoherrakunnaksi 1905 ja jälkimmäinen 1914. Seurakunnassa toimi Gloskärin hospitaali spitaalisia varten 1643–1672, jonka jälkeen se yhdistettiin Seilin hosipitaaliin.
Muut nimet
Fogelö, Fouglerö, Fyghelde
Kylät
Bänö, Björkör, Björsboda, Brändö, Bråttö, Degerby, Finholma, Flisö, Granboda, Hastersboda, Horsholma, Hummersö, Järsö, Jyddö, Kallsö, Klåvskär, Nötö, Överö, Sanda, Skogboda, Sommarö, Sonnboda, Stentorpa, Ulversö
Naapuriseurakunnat
Papisto
Kirkkoherrat
1544 Eskil
1548–1555 Olaus Olai
1558–1561 Martinus
1562–1564 Laurentius
1565–1581 Michael Gregorii Slutaeus
1581–1601 Jonas Olaii
1603–1616 Ericus Laurentii Bång
1617–1640 Olaus Sigfridi
1640–1668 Ericus Nicolai Nybopensis
1670–1671 Gabriel Olai Hamnodius
1673–1691 Gudmund Rothovius
1692–1711 Daniel Mansnerus
1711–1737 Johan Stålbom
1737–1757 Anders A. Backman
1759–1765 Petter Svebilius (Oxendal)
1767–1809 Gustaf Allenius
1812–1823 Matias Enegren
1826–1847 Anders Mikael Lundenius
1849–1861 Karl Ulrik Wessel
1864–1885 Klas Adolf Karsten
1889–1892 Jakob Nordqvist
1893–1906 Karl Sixtus Olsson
1908–1938 Juho Edvard Törnroos
Ylimääräiset papit
1616–1617 Sigfridus Canuti
1625–1629 Clmens Georgii
1630–1640 Ericus Nicolai Nybopensis
1651–1667 Erik Portulinus
1665–1670 Petrus Portulinus
1683–1694 Gabriel Rothovius
1695–1697 Johan Stålbom
1698–1705 Paulus Mansnerus
1706–1708 Andreas Mansnerus
1708–1711 Johan Stålbom
1714 Matthias Grunnerus
1726–1739 Anders Backman
1739–1759 Karl Ekroth
1740–1744 Johan Brunnerus
1754–1758 Anders Backman
1766–1771 Matthias Tecklenius
1788–1789 Johan Ledmarck
1798–1811 Mikael Urgren, kirkkoherran apulainen
1807–1812 Nils Gustaf Bergstenius, sijaiskirkkoherra
1812–1817 Adolf Engelbrekt Herpman, kirkkoherran apulainen
1817–1818 Gustaf Englund, kirkkoherran apulainen
1823–1826 Jakob Holm, sijaiskirkkoherra
1827–1828 Gustaf Henrik Ingman, kirkkoherran apulainen
1828–1829 Karl Johan Palander, kirkkoherran apulainen
1830 Bror Henrik Reinhold Aspelin, kirkkoherran apulainen
1831–1832 Josef Heldán, kirkkoherran apulainen
1833–1838 Isak Eriksson, kirkkoherran sijainen
1838–1849 Matias Forsberg, kirkkoherran sijainen, vt. kirkkoherra
1861–1862 Oskar Grönholm, vt. kirkkoherra
1862–1864 Karl Selim Fritjof Bergroth, vt. kirkkoherra
1882–1883 Jakob Ferdinand Manner, vt. kirkkoherra
1883–1885 David Anton Aimonen, vt. kirkkoherra
1885–1889 Jakob Nordqvist, vt. kirkkoherra
1892–1893 Johan Axel Friberg, vt. kirkkoherra
1898 Karl Julius Jonatan Helander, vt. kirkkoherra
1906–1908 Juho Edvard Törnroos, vt. kirkkoherra
Arkisto
Föglön seurakunnan rippikirjat alkavat vuodesta 1739, tilikirjat vuodesta 1709 ja historiakirjat vuodesta 1657. Seurakunnan vanhinta arkistoa säilytetään Kansallisarkisto Jyväskylässä ja aineistokokonaisuus kattaa vuodet 1648–1943.
Kansallisarkisto on digitoinut Föglön seurakunnan vanhimmat kirkonkirjat noin 1860-luvulle saakka ja aineisto on vapaasti tutkittavissa Astia-palvelussa. Föglön ja muiden Ahvenanmaan seurakuntien kirkonkirjat noin vuoteen 1885 on digitoinut ruotsalainen yritys ArkivDigital, joka tuottaa ja tarjoaa asiakkailleen historiallisia aineistoja verkossa.